专著与编著：

[1]诸葛净. 辽金元时期北京城市研究[M]. 南京: 东南大学出版社, 2016.

[2]诸葛净, 白颖. 苏州东山轩辕宫[M]. 天津: 天津大学出版社, 2016.

[3]张十庆, 诸葛净, 编.江南寺观[M]. 北京: 中国建筑工业出版社, 2020.

主要发表论文：

[1]诸葛净, 薛景勃. “厅堂”与“厅堂(式构架)”：一个词语的分裂史[J]. 建筑学报, 2021(04): 100–107.

[2]白颖, 诸葛净. 展示传统：东南大学建筑学院藏基泰工程司古建筑模型研究[J]. 建筑学报, 2021(10): 90–96.

[3]王佳琦, 诸葛净, 任思捷*. 尼泊尔帕坦博物馆的行动者及其“本土”话语生产[J]. 建筑学报, 2021(02): 111–118.

[4]丁伯仪, 诸葛净*, 任思捷. 信仰、像设与建筑：宁波保国寺大殿增设下檐现象研究[J]. 建筑学报, 2021(S1): 47–54.

[6]诸葛净. 瞬时惊奇：对作为社会现象的南京大报恩寺遗址公园的一种观察[M]//建筑文化研究（第9辑）. 上海: 同济大学出版社, 2020: 15–40.

[7]诸葛净, 梅晨曦, 任思捷, 等. 为何注释：“中国古代建筑术语注释与翻译”研究的目标与途径[J]. 建筑学报, 2020(09): 88–94.

[8]白颖, 诸葛净. 水网之外、体系之中:太湖东西山聚落研究[J]. 建筑遗产, 2020(2): 10–17.

[9]诸葛净. 花园：暧味之地——居住：从中国传统城市住宅到相关问题系列研究之五[J]. 建筑师, 2017(1): 93–98.

[10]诸葛净. 个性、自治、平等与关于房间的想象：20世纪初中国城市中等阶级居住观念中的理想住宅  ——居住：从中国传统城市住宅到相关问题系列研究之六[J]. 建筑师, 2017(6): 61–68.

[11]诸葛净. 时空中的缝隙:明代城市中“公共”空间的涵义及其时间性——居住:从中国传统住宅到相关问题系列研究之四[J]. 建筑师, 2016(第6期): 87–94.

[12]诸葛净. 厅：身份、空间、城市——居住：从中国传统住宅到相关问题系列研究之一[J]. 建筑师, 2016(3): 72–79.

[13]诸葛净. 上房：性别空间与私的概念——居住：从中国传统城市住宅到相关问题系列研究之三[J]. 建筑师, 2016(第5期): 90–96.

[14]诸葛净. 建筑类型问题：从厅、堂说起——居住：从中国传统住宅到相关问题系列研究之二[J]. 建筑师, 2016(4): 6–12.

[15]周觅, 诸葛净. 作为管理手段的学术会议：1958年全国建筑历史学术讨论会的性质与作用[J]. 建筑与文化, 2015(第6期): 173–175.

[16]ZHUGE J. From Historical Monumentto New“Urban Spectacle”[M]//Architecture Reperformed: The Politics ofReconstruction. Longdon: Ashgate Pub Co., 2015: 117–135.

[17]诸葛净. 断裂或延续:历史、设计、理论：1980年前后《建筑学报》中“民族形式”讨论的回顾与反思[J]. 建筑学报, 2014(9): 53–57.

[18]诸葛净. 寻找中国的建筑传统 1953—2003年中国建筑史学史纲要[J]. 时代建筑, 2014(1): 166–169.

[19]诸葛净. 从历史纪念物到新“都市奇观”  ——南京大报恩寺塔重建项目的案例研究[J]. 同济大学学报(社会科学版),2014(5): 79-87，93.

[20]诸葛净, 张剑葳. 南京城墙建置史[M]//南京城墙与罗马城墙比较（中英双语）. 南京: 东南大学出版社, 2013:2–19.

[21]诸葛净. 历史写作的迷宫：读《建筑文化研究》“威尼斯学派与城市”专辑[J]. 建筑师, 2012, 157(3): 94–96.

[22]诸葛净. 营造/建筑：中国古代建筑关键词研究[J]. 建筑师, 2011, 153(5): 73–77.

[23]ZHUGE J. Emperor of China &Khan of Mongolia: a Study on the Cultural Duality in the Layout of Palaces inYuan Dadu[M]//Along the Great Wall: Architecture and Identity in China andMongolia. Vienna: IVA-ICRA, 2010: 71–78.

[24]诸葛净. 论辽之京城体系[J]. 华中建筑, 2009(7): 143–147.

[25]诸葛净. 明洪武时期南京宫殿之礼仪角度的解读[M]//建筑史. 北京: 清华大学出版社, 2009: 64–80.

[26]诸葛净. 城中之城—江宁满洲驻防考[M]//建筑历史与理论研究文集（1997-2007）. 北京: 中国建筑工业出版社, 2007: 250–267.

[27]诸葛净. 出世与入世——辽金元时期北京城市与寺院宫观研究[J]. 建筑师, 2006, 122(4): 58–64.

[1]马嘉琪. 北魏平城（398-494）房形石堂墓研究[D]. 东南大学, 2021.

[2]王丽佳. 图与物——四本宋刊书籍中物品插图的初步研究[D]. 东南大学, 2021.

[3]陈婷. 南京新鸡鸣寺研究[D]. 东南大学, 2020.

[4]王清爽. 苏中地区明代住宅建筑大木特征研究[D]. 东南大学, 2020.

[5]孙迎喆. 多方参与下的尼泊尔遗产保护管理研究——以加德满都谷地巴克塔普尔为中心[D]. 东南大学, 2020.

[6]丁伯仪. 信仰、像设、建筑与建造：10-14世纪江南地区单檐木构后期增设下檐现象研究[D]. 南京: 东南大学, 2020.

[7]王倩. 鼓楼医院建设研究[D]. 东南大学, 2019.

[8]梁静. 市镇中的茶馆与茶馆中的市镇——以清至民国江南市镇盛泽为中心[D]. 东南大学, 2018.

[9]梁欣婷. 1928-1937年南京市平民住宅研究[D]. 东南大学, 2017.

[10]李阳. 武义延福寺研究史[D]. 东南大学, 2017.

[11]周觅. 意识形态、制度与建筑史——以1958年全国建筑历史学术讨论会为中心的史学史[D]. 东南大学, 2017.

[12]沈俊超. 南京历史文化名城保护规划演进及展望[D]. 东南大学, 2016.

[13]郭子君. 基于Rough set理论和Ontology的传统古建聚落建筑外观风貌导则编制技术研究[D]. 东南大学, 2015.

[14]殷如清. 明清江南私家园林室外地面铺装研究[D]. 东南大学, 2013.