1）   主持基于多模态时空数据的大学校园户外公共空间形态与活力的关联机制及优化模式研究 ——以南京为例（项目编号: 52078113），国家自然科学基金，2021,1——2024,12

2）   主持传统村落活态化保护利用的关键技术与集成示范子课题一，“十三五”国家重大专项课题，2019.11-2022.12.31，资助额度：523万，项目批准号：2019YFD1100904

3）   主持高校既有校园建筑性能提升与空间长效优化模式研究（项目编号: 51678123），国家自然科学基金，2017,1——2020,12

4）   主持基于DPE(设计效能评价)的民国建筑渐进式性能提升模式研究——以南京为例（项目编号: 51208089），国家自然科学基金，2013,1——2015,12

5）   为主参与数值模拟和遗传算法联合驱动的多目标性能化住区规划设计研究（项目编号: 51008058），国家自然科学基金，石邢，吴锦绣等（排名2），2011,1——2013,12

6）   为主参与国家科技部“十一五”科技支撑项目“村镇住宅施工验收标准研究”（项目编号: 2008BAJ0811），负责建筑分课题研究，陈忠范，吴锦绣等（排名2），2007——2010

7）   为主参与基于遗传算法和可度量性能的住区规划设计研究-以长三角为例，教育部博士点科研基金（20100092120001），石邢，吴锦绣（排名2）， 2011,1——2013,12

论著：

1)  《杨廷宝全集-建筑卷》（下），吴锦绣，鲍莉参编，中国建筑工业出版社，2021年1月

2)  《杨廷宝全集-建筑卷》（上），鲍莉，吴锦绣参编，中国建筑工业出版社，2021年1月

3)  《大学校园建筑与环境》，吴锦绣，张玫英，中国建筑工业出版社，2021年11月

4)  《建筑设计入门教程》，朱雷，吴锦绣，陈秋光，朱渊，东南大学出版社，2018年5月

5)  《2012江苏乡村调查——泰州篇》，王建国，龚恺，吴锦绣，薛力，商务印书馆，2015年4月，（获国家出版基金）

论文：

1)  吴锦绣,张玫英,范琳琳,徐明.高校既有建筑空间长效优化设计方法研究——南京大学鼓楼校区西南楼的改造[J].工业建筑,2021,51(01):17-23.

2)  WU Jinxiu, DONG Wei, LI Yonghui, FU Xiu, Ecological Renovation Process of  Nanjing’s Housing Stock built between 1840 and 1949, China, JAAB(SCI, A&HCI)，Volume 19 Issue 3, 2020, P. 254-263

3)  吴锦绣，赵琳，“从拥抱自然到梦想校园：美国大学校园形态发展及启示”，华中建筑，Vol. 38, No.276, 2020年5月，P. 10-15.

4)  吴锦绣，朱雷，史永高，易鑫，“复杂城市环境视角下的社区中心设计”课程实践研究，建筑学报，2017年第1期，P. 50-53

5)  吴锦绣，张玫英，“Study on High Comfort and Low Energy Consumption Community Design in China”，《Open House International》（SSCI，A&HCI检索），Vol. 4o, No. 3, 2015，P.32-36 

6)  吴锦绣，董卫，李永辉，傅秀章，淳庆，旧建筑，新生活——基于渐进式性能提升的南京中农里民国住宅区保护更新，建筑学报，2013年第8期，P. 99-103

7)  吴锦绣，陈晓阳，张慧，绿色建筑设计理念在教学中的运用，建筑学报，2011年第11期，P. 95-97

8)  吴锦绣，英才培养，理念先行——论哈佛大学设计学院的建筑教育，建筑学报，2009年第3期，P. 92-96