【潘旻导师】招生“医学院”研究生介绍
潘旻
副教授
硕士生导师
女
医学院
基础医学
,生物医学工程
高通量测序技术,游离核酸的检测与分析,无创胚胎植入前筛查的应用研究,分子病理学
101012091@seu.edu.cn
现任东南大学医学院副教授，硕士研究生导师，病理系副主任。本科和硕士毕业于东南大学， 2013-2015年赴美国威斯康辛大学麦迪逊分校联合培养，2016年在东南大学获得博士学位。主要研究方向包括：高通量生物检测技术，孕妇外周血游离核酸在早期无创产前诊断中的应用研究以及胚胎培养液游离核酸在无创胚胎植入前筛查中的应用研究等。主持国家自然科学基金，江苏省自然科学基金面上项目，东南大学-江苏省人民医院联合开放课题各一项；参与国家重点研发计划项目课题、国家自然科学基金面上项目等多项。在SCI期刊发表论文二十余篇。荣获全国青年教师病理学教学竞赛总决赛一等奖，中国MBBS青年教师英语授课竞赛二等奖，江苏省外国留学生英语授课竞赛一等奖，东南大学教学成果二等奖等。主持或参与校级教改项目四项，在线开放课程《病理形态实验学》获省级一流本科课程。
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科研项目
1、国家自然科学基金青年项目，孕妇外周血胎儿DNA的生物学特征用于无创产前诊断的研究，2019/01-2021/12，结题，主持。
2、江苏省自然科学基金面上项目，胎儿DNA分离方法及其在无创产前诊断中的应用研究，2021/07-2024/06，结题，主持。
3、东南大学-江苏省人民医院联合开放课题，基于卵泡芯片的氧环境在卵母细胞体外培养中的作用研究，2024/07-2026/06，在研，主持。
4、国家重点研发计划项目课题，重大呼吸慢病动物模型生物样本库和多模分析数据库建立，2023/01-2027/12，在研，参加。
5、国家自然科学基金面上项目，LncRNAHCP5编码蛋白调控14-3-3ζ促进三阴乳腺癌恶性进展的机制研究，2020/01-2023/12，结题，参加。
6、国家自然科学基金面上项目，基于三代高通量测序的环状RNA可翻译性研究，2019/01-2022/12，结题，参加。
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研究成果
1. Pan M, Shi H, Liu Z, Dong J, Cai L, Ge Q: The integrity of cfDNA in follicular fluid and spent medium from embryo culture is associated with embryo grade in patients undergoing in vitro fertilization. J Assist Reprod Genet 2022, 38(12):3113-3124.
2. Pan M, Lu J, Liu Z, Shi H, Bai Y, Chen P, Ge Q: Integrity of cell-free DNA in maternal plasma extracellular vesicles as a potential biomarker for non-invasive prenatal testing. Int J Gynaecol Obstet 2021, 158(2):406-417.
3. Pan M, Chen P, Lu J, Liu Z, Jia E, Ge Q: The fragmentation patterns of maternal plasma cell-free DNA and its applications in non-invasive prenatal testing. Prenat Diagn 2020, 40(8):911-917.
4. Pan M, Schwartzman JA, Dunn AK, Lu Z, Ruby EG: A Single Host-Derived Glycan Impacts Key Regulatory Nodes of Symbiont Metabolism in a Coevolved Mutualism. mBio 2015, 6(4):e00811.
5. Shi H, Pan M, Jia E, Lu W, Zhou Y, Sheng Y, Zhao X, Cai L, Ge Q: A comprehensive characterization of cell-free RNA in spent blastocyst medium and quality prediction for blastocyst. Clin Sci (Lond) 2023, 137(2):129-120.
6. Qi T, Pan M, Shi H, Wang L, Bai Y, Ge Q: Cell-free DNA fragmentomics: the novel promising biomarker. Int J Biol Sci 2023, 24(2):1503
7. Shi H, Ge Q, Pan M, Sheng Y, Qi T, Zhou Y, Sun Y, Bai Y, Cai L: Agarose amplificaiton based sequencing characterization cell-free RNA in preimplantation spent embryo medium. Anal Chim Acta 2024, 1926
8. Shi H, Pan M, Sheng Y, Jia E, Wang Y, Dong J, Tu J, Bai Y, Cai L, Ge Q: Extracellular cell-free RNA profile in human large follicles and small follicles. Front Cell Dev Biol 2022, 10:940336.
9. Zhou Y, Qi T, Pan M, Tu J, Zhao X, Ge Q: Deep-Cloud: a deep neural network-based approach for analyzing differentially expressed genes of RNA-seq data. J Chem Inf Model 2023.
10. Zhou Y, Jia E, Sheng Y, Qiao Y, Wang Y, Shi H, Liu Z, Pan M, Tu J, Bai Y, Ge Q: Sensitive and Low-Bias Transcriptome Sequencing Using Agarose PCR. ACS Appl Mater Interfaces 2022, 14(17):19154-19167.
11. Jia E, Zhou Y, Shi H, Pan M, Zhao X, Ge Q: Effects of brain tissue section processing and storage time on gene expression. Anal Chim Acta 2021, 1142:38-47.
12. Zhou Y, Jia E, Qiao Y, Shi H, Liu Z, Pan M, Zhao X, Bai Y, Ge Q: Low bias multiple displacement amplification with confinement effect based on agarose gel. Anal Bioanal Chem 2021, 413(17):4397-4405.
13. Zhou Y, Jia E, Pan M, Zhao X, Ge Q: Encoding Method of Single-cell Spatial Transcriptomics Sequencing. Int J Biol Sci 2020, 16(14):2663-2674.
14. Shi H, Zhou Y, Jia E, Pan M, Bai Y, Ge Q: Bias in RNA-seq Library Preparation: Current Challenges and Solutions. Biomed Res Int 2021, 2021:6647597.
15. Jia E, Pan M, Liu Z, Zhou Y, Zhao X, Dong J, Bai Y, Ge Q: Transcriptomic profiling of differentially expressed genes and related pathways in different brain regions in Parkinson's disease. Neurosci Lett 2020, 732:135074.
16. Liu Z, Wang Z, Jia E, Ouyang T, Pan M, Lu J, Ge Q, Bai Y: Analysis of genome-wide in cell free DNA methylation: progress and prospect. Analyst 2019, 144(20):5912-5922.
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